Comparação de Redes Neurais na Segmentação de Vasos Sanguíneos em Imagens Médicas

Autor: Ivan Duarte Calvo

Orientador: Prof. Dr. Cesar H. Comin

Esse é o repositório com os notebooks e gráficos gerados no desenvolvimento do Trabalho de Conclusão de Curso realizado no Departamento da Computação da Universidade Federeal de São Carlos no curso de Bacharelado em Ciência da Compuação.

Notebooks

No repositório há notebooks utilizados para preparar o dataset, treinar os modelos, testar checkpoints e criar plots para visualização dos resultados. Todos eles estão presentes na pasta src/code

• Normalização do dataset.ipynb: Notebook utilizado para calcular os valores necessários para a normalização do conjunto de dados.
• Run.ipynb: Notebook utilizado para o treinamento e teste de um modelo.
• Testes.ipynb: Notebook utilizado para carregar e testar um checkpoint criado no notebook Run.ipynb.
• Plots.ipynb: Notebook utilizado para criar os plots. Os dados estão na pasta data/runsDataTorchseg

Referências

Curso de Visão Computacional do Prof. Dr. Cesar Comin, presente no repositório https://github.com/chcomin/curso-visao-computacional-2024/

Biblioteca TorchSeg disponível em: https://github.com/isaaccorley/torchseg

TensorBoard disponível em: https://github.com/tensorflow/tensorboard/

clDice: https://github.com/jocpae/clDice