Mamografi Radyoloji Raporlarından Varlık İsmi Çıkarımı ve BIRADS Kategori Tahmini

Bu proje, mamografi radyoloji raporlarından varlık ismi çıkarımı (VİÇ) ve BIRADS (Breast Imaging-Reporting and Data System) kategori tahmini yapmayı hedeflemektedir. Proje kapsamında iki temel görev gerçekleştirilmiştir: birincisi BIRADS kategori tahmini, ikincisi ise varlık ismi çıkarımıdır.

Proje İçeriği

• BIRADS Kategori Tahmini: BIRADS kategorilerinin tahmini için BERT modeli kullanılmıştır.

  • BIRADS-1 sınıfı için veri dengesizliği olduğu tespit edilmiş ve artırma (augmentation) yöntemleri uygulanarak denge sağlanmıştır.
  • Model eğitimi sonrasında test işlemi gerçekleştirilmiş ve sonuçlar precision, recall, f1-score ve accuracy metrikleri ile değerlendirilmiştir.

• Varlık İsmi Çıkarımı (VİÇ): Varlık ismi çıkarımı işlemi için Spacy kütüphanesi kullanılmıştır.

  • Modelin performansı F1-score, precision ve recall metrikleri ile değerlendirilmiştir.
  • Çıktı dosyası, yarışma için istenilen JSON formatında sunulmuştur.

Proje Yapısı

Proje aşağıdaki ana klasör ve dosyalardan oluşmaktadır:

• Birads-viç/
  • ikinciAsama: Jupyter Notebook kaynaklı dosyalar ve proje boyunca gerçekleştirilen tüm aşamaları içerir.
  • NLPdemo: İkinci aşama için yapılan deneme kodlarını içerir.
  • öznitelik: Projede kullanılan öznitelik çıkartma işlemlerine ait kodları içerir.
  • VİÇ: Varlık ismi çıkarımı için yapılan deneme kodlarını içerir.

Kullanılan Modeller ve Teknolojiler

BIRADS Kategori Tahmini

• Model: BERT (Bidirectional Encoder Representations from Transformers)
• Veri Artırma: BIRADS 1 için veri dengesizliğini gidermek amacıyla veri artırma (data augmentation) teknikleri kullanılmıştır.
• Metrikler: Precision, Recall, F1-Score, Accuracy

Varlık İsmi Çıkarımı (VİÇ)

• Model: Spacy NER (Named Entity Recognition)
• Metrikler: Precision, Recall, F1-Score

Kurulum

Bu projeyi kendi bilgisayarınızda çalıştırmak için aşağıdaki adımları izleyebilirsiniz.

1. Python Gereksinimleri: Proje, Python 3.x ile uyumludur. Gerekli kütüphaneleri yüklemek için aşağıdaki komutu çalıştırın:

   pip install -r requirements.txt