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Contexte

• Beaucoup de gens ont le temps d'apprendre sur le génome du virus à la maison
• Créer du matériel d'apprentissage à domicile pour les débutants en bioinformatique

How to Map COVID-19 Spread?

• Pour lancer les scripts, copiez d'abord ce tutoriel pour vous: File > Save a copy in Drive
• Tutoriel (5 min)

Qu'est-ce qu'une Séquence ARN?

• Dans ce tutoriel, nous analyserons les séquences ARN de 4 coronavirus:
  • SARS-Cov-2 (COVID 19) [MN908947]
  • SARS related coronavirus [AY27411.3]
  • MERS-related-coronavirus [JX869059.2]
  • Guandong chinese water stink coronavirus [MG600026.1]

Comment Télécharger les Séquences ?

• Comment télécharger les données de séquence ARN des coronavirus à partir des archives de données publiques.
• Tutoriel (5 min)

Comment Calculer le Contenu en GC ?

• La séquence ARN est constituée de 4 types de caractères (= nucléotides): A & T(U) & G & C. Quelle est la proportion de G & C?
• Tutoriel (5 min)

Comment Comparer les Longueurs de Poly-A ?

• Tutoriel

ATGC ou AUGC, lequel et pourquoi ?

• Tutoriel

Où Sont les Gènes ?

• A partir de la séquence, les protéines sont traduites. Ces régions de la séquences sont appelées cadre ouvert de lecture ou open reading frame (ORF).
• Tutoriel (10min)

Comment Dessiner un Arbre Phylogénétique ?

• Tutoriel (10 min)